In Staffel 2 folgt Lyra Lord Asriel in die geheimnisvolle verlassene Stadt Cittagazze. Dort trifft sie auf Will, einen Jungen aus unserer Welt, der ebenfalls vor einer problematischen Vergangenheit davonläuft. Währenddessen setzt Mrs. Coulter ihre Bemühungen fort, Lyra nach Hause zu bringen.
Waise Lyra lebt in einer Parallelwelt – der unseren ganz ähnlich –, in der Wissenschaft, Theologie und Magie eng miteinander verwoben sind. Als ihr bester Freund verschwindet, macht Lyra sich auf die Suche nach ihm und kommt einer finsteren Verschwörung auf die Spur. Sie muss herausfinden, was es mit dem seltsamen »Staub« auf sich hat…
Philosophie ist, als ob jemand in einem dunklen Raum mit verbundenen Augen eine schwarze Katze sucht, die es gar nicht gibt.
Theologie ist, als ob jemand in einem dunklen Raum ebenfalls mit verbundenen Augen eine schwarze Katze sucht, die es gar nicht gibt und plötzlich ruft: „Ich hab sie!…“